如何遏制甚至根除艾滋病，已成为我国乃至世界科学家面临的重大课题。郑永唐，这位由“西部之光”和中科院创新工程哺育和培养起来的青年科学家，以出色的成绩，为这个重大课题努力奋斗着。
郑永唐从事免疫学和病毒学方面的研究工作多年１９９５年以来他先后主持了２０多项国家、中科院和云南省的科研项目，尤其在中草药和天然化合物抗ＨＩＶ活性研究方面积累了丰富的经验，取得了显著的成绩，处于国内领先和国际先进水平。他先后在国内外学术刊物上发表相关学术论文５０多篇，申请国际专利一项，申请国家发明专利１６项。２００２年他被授予“云南省中青年学术和技术学科带头人”称号，２００３年被中国科学院授予“中国科学院防治非典型肺炎工作优秀共产党员”荣誉称号。
１９９５年５月，郑永唐参与建成了从事ＨＩＶ研究的“中国科学院昆明生物安全三级实验室（ＢＳＬ－３实验室）”，这是２００３年ＳＡＲＳ爆发前中科院唯一的ＢＳＬ－３实验室。２０ ０３年，为了开展ＳＡＲＳ方面的研究，他又主持建成了新的ＢＳＬ－３实验室和可进行１８只灵长类动物研究的ＡＢＳＬ－３实验室。中国科学院昆明ＢＳＬ－３实验室是全国少数几家获准可从事灵长类动物危险微生物感染模型实验的ＡＢＳＬ－３实验室，为全国各科研机构和医药集团进行艾滋病研究提供了坚实的平台。
为了充分利用云南丰富的动植物资源和天然药物资源，加速抗病毒天然药物的研究步伐，研制具有我国自主知识产权的抗病毒天然药物，郑永唐又与中科院昆明植物研究所植物化学国家重点实验室联合成立了“中国科学院西南基地抗病毒天然药物联合实验室”。该实验室首次以猴艾滋病病毒为对象，建立了适用于无Ｐ３实验室条件时筛选ＡＩＤＳ药物的体外实验模型，在国内较早地建立了一套完整的体外抗ＨＩＶ药物筛选和研究方法，并在此基础上与国内外３０多家研究单位开展了抗ＨＩＶ药物的合作研究，筛选和研究了来源于动物、植物和海洋生物中分离纯化的２０００多种化合物的抗ＨＩＶ活性，发现了酒花查尔酮、黄芩甙锌等一系列新天然化合物具有极显著的抗ＨＩＶ活性。
郑永唐和其他科学家一起首次发现了天花粉蛋白（ＴＣＳ）有抗白血病和淋巴瘤的作用，ＴＣＳ抗艾滋病的效果可能与其选择性的细胞毒性有关。他们通过检测发现，ＴＣＳ抗ＨＩＶ－１活性与其抗ＨＩＶ活性主要与核糖体失活的活性相关，但又不是唯一的因素。
郑永唐与昆明植物研究所植物化学国家重点实验室的陈纪军博士一起，从筛选抗ＨＩＶ活性有效的天然化合物中，选择８种抗ＨＩＶ作用靶点不同的天然化合物组成“奇士乐”复方，经ＡＩＤＳ治疗国家定点临床医院——北京地坛医院在河南省商丘地区临床试用１０名患者，初步效果显著。治疗艾滋病新药“奇士乐”胶囊的研究已获２００４年国家科技部十五国家重大科技专项“创新药物和中药现代化”和云南省科技厅新药研究开发专项的经费支持。
郑永唐还与昆明植物研究所植物化学国家重点实验室的刘吉开博士合作，从云南产高等真菌发酵液中大量提取分离精制得到一个结构新颖的具有抗ＨＩＶ生物活性的化合物，命名为炭球菌素，为一新的结构骨架类型。目前，治疗艾滋病新药“炭球菌素”研究开发已获２００４年云南省科技厅新药研究开发专项资助。
利用ＢＳＬ－３实验室平台，郑永唐研究的多种抗ＨＩＶ药物，如天花粉蛋白突变体、西夫韦肽和ＴＣＳ－ＰＥＳ等均完成了国家药品和食品监督管理局所要求的临床前研究，取得了很好的社会和经济效益。他还完成了抗ＡＩＤＳ中药“唐草片”临床试验中部分试验患者的ＣＤ４、ＣＤ８测定，该中药于２００４年４月８日获得ＳＦＤＡ批准临床应用，是我国批准临床应用的第一种用于改善艾滋病症状的中药，使昆明动物所成为全国少数几家具备进行符合ＳＦＤＡ抗ＨＩＶ药物研究条件的单位。
在２００３年抗击ＳＡＲＳ的斗争中，作为ＳＡＲＳ研究攻关小组副组长的郑永唐毫不犹豫地接受了科学院和所领导布置的ＳＡＲＳ研究任务，具体负责ＳＡＲＳ研究技术层面和改扩建Ｐ３实验室的工作，提出并主持了“建立ＳＡＲＳ病毒感染灵长类动物模型”、“应用灵长类动模型进行ＳＡＲＳ病毒疫苗和药物的效果评价”、“抗ＳＡＲＳ病毒药物细胞与分子筛选模型的建立和天然药物研究”、“ＳＡＲＳ病毒特异蛋白的表达、诊断和治疗性抗体的研制”等项目的研究工作，得到了同行一致好评。
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